Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms