Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms