Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C16orf54Q6UWD8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms