Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms