Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL54Q6P161 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL54Q6P161 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL54Q6P161 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL54Q6P161 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL54Q6P161 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL54Q6P161 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL54Q6P161 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL54Q6P161 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MRPL54Q6P161 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL54Q6P161 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms