Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms