Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS3Q68E01 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms