Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms