Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIPQ5VU43 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms