Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF20Q5VTR2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms