Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BEND3Q5T5X7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms