Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms