Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms