Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF1Q3BBV0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms