Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UVSSAQ2YD98 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UVSSAQ2YD98 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms