Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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