Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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