Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PCK2Q16822 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PCK2Q16822 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PCK2Q16822 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCK2Q16822 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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