Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA3Q16787 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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