Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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NRF1Q16656 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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NRF1Q16656 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRF1Q16656 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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NRF1Q16656 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRF1Q16656 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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