Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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