Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALX1Q15699 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms