Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGN3Q15651 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms