Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms