Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF4Q15306 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms