Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRKQ15262 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
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