Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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BRD3Q15059 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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BRD3Q15059 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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