Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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