Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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