Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MDC1Q14676 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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