Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms