Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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