Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTAN1Q13813 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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