Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms