Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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