Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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