Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NAE1Q13564 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms