Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1orf61Q13536 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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