Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PICALMQ13492 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms