Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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