Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms