Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLAMF1Q13291 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLAMF1Q13291 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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