Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERCC8Q13216 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERCC8Q13216 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERCC8Q13216 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERCC8Q13216 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERCC8Q13216 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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ERCC8Q13216 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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ERCC8Q13216 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERCC8Q13216 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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ERCC8Q13216 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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ERCC8Q13216 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ERCC8Q13216 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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ERCC8Q13216 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERCC8Q13216 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERCC8Q13216 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ERCC8Q13216 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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ERCC8Q13216 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERCC8Q13216 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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