Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAF1AQ13111 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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