Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRDM2Q13029 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRDM2Q13029 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRDM2Q13029 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
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