Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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GRIK2Q13002 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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GRIK2Q13002 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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