Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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