Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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FOXD4Q12950 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXD4Q12950 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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