Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMAN2Q12907 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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