Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2AQ12879 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2AQ12879 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
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